在未来的东京，一种名为“暗变”的神秘基因病毒悄然蔓延，感染者会获得超能力，但也会逐渐失去人性。主角林一是一名记者，在调查一起离奇失踪案时，意外发现政府秘密进行的基因实验。他结识了拥有控制金属能力的少女小雅，两人携手深入地下研究所，却遭遇了实验体“暗兽”的袭击。随着真相浮出水面，林一发现自己的基因也被改造，他必须在力量与人性之间做出抉择，阻止一场毁灭东京的阴谋。